15 Temmuz gecesi yaşanan darbe girişiminin ardından birçok kurum ve kuruluşta başlatılan incelemeler doğrultusunda bazı eğitim kurumlarının kapatılmasına karar verilmişti. Bunlardan bir tanesi de yönetici ve akademik personelinin FETÖ yapılanmasıyla yakın ilişkisi olduğu bilinen Fatih Üniversitesi olmuştu. Ancak Fatih Üniversitesi, isim benzerliğinden dolayı öğrenci ve ebeveynler tarafından Fatih Sultan Mehmet Vakıf Üniversitesi ile karıştırıldı. Yanlış anlaşılma dolayısıyla açıklama yapan Fatih Sultan Mehmet Vakıf Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Musa Duman, “Fatih Sultan Mehmet Vakıf Üniversitesi 2010 yılında Vakıflar Genel Müdürlüğü tarafından kurulan bir üniversite. Vakıf üniversiteleri arasında doğrudan Vakıflar Genel Müdürlüğü’nün kurduğu 2 üniversiteden biri. Bu anlamda devlet üniversiteleri arasında yer alabilecek statüde bir üniversiteyiz. 22 Haziran 2016 tarihindeki üçüncü mezuniyet törenimizi ve iftar programımızı da Cumhurbaşkanımız Recep Tayyip Erdoğan’ın teşrifleriyle gerçekleştirmiş idik. Dolayısıyla herhangi bir kişi, grup ya da cemaatle hiçbir şekilde irtibatı olmayan bir kurumuz. Son yıllarda isim benzerliği sebebiyle üniversitemiz bazı kişilerce Fatih Üniversitesi ile karıştırılıyor. Son gelişmeler sonucunda Fatih Üniversitesi kapatılmıştır. Artık öğrenci alamayacak. Tanıtım Tercih döneminde çağrı merkezimize Fatih Üniversitesi ile ilişkimiz olup olmadığı konusunda ve kapatılıp kapatılmayacağımız konusunda çok fazla telefon gelmeye başladı. Bu doğrultuda kamuoyunu aydınlatmak elzemdir.
Fatih Sultan Mehmet Vakıf Üniversitesi’nin herhangi bir kişi, grup veya cemaatle ilintili olma durumu söz konusu değildir. Doğrudan Vakıflar Genel Müdürlüğü’nün üniversitesi olarak eğitimimize devam ediyoruz. Kontenjanlarımızı duyurduk, Ölçme, Seçme ve Yerleştirme Merkezi’nin (ÖYSM) kılavuzunda da yer alıyoruz. Kontenjanlarımız nispetinde öğrenci alacağız ve eğitimimize devam edeceğiz” açıklamalarında bulundu.
